El Ejecutor de Contrato de Administración de la Reserva Comunal Amarakaeri (ECA AMARAKAERI) fue constituido el 17 de junio de 2005 en la Sunarp Tambopata para representar inicialmente a 8 CCNN Harakbut, Yine y Machiguenga. En 2010 se incorporó a las CCNN de Masenawa y Queros. Además de estas 10 CCNN, también está conformado por dos OOII: la Federación Nativa del Río Madre de Dios y Afluentes (FENAMAD) y el Consejo Harakbut Yine Matsiguenka (COHARYIMA). El 18 de diciembre de 2006 el ECA firmó su contrato de administración. Su oficina se encuentra en la ciudad de Puerto Maldonado (Madre de Dios).
El ECA AMARAKAERI fue el primer ECA que gestionó la adenda de servicios ecosistémicos al contrato de administración en 2016. Ello, como parte del proceso de construcción e implementación de la propuesta de ambición climática de REDD+ Indígena Amazónico (RIA) con enfoque de contrato de administración, en la Reserva Comunal Amarakaeri (RCAMA) y sus comunidades socias. En el marco de este proceso, en 2015 el ECA incorporó el enfoque de RIA al Plan maestro 2016-2020 de la RCAMA, al cual articuló su Plan de vida institucional en 2018. Estableciendo, de esta manera, los pasos para la implementación de RIA en reservas comunales. Con las comunidades socias se vienen impulsando las cadenas de plátano, castaña, cacao nativo y piscigranjas.
El ECA AMARAKAERI cuenta con experiencia en la ejecución de fondos directos desde 2010 y desde su creación ha recibido el apoyo de diferentes organizaciones: la Agencia de los Estados Unidos para el Desarrollo Internacional (USAID), el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD), la ONG belga BOS+, el Fondo Flamenco de Bosques Tropicales (FFBT), Conservación Internacional (CI), la Sociedad Peruana de Derecho Ambiental (SPDA), DRIS/Desarrollo Rural Sustentable, entre otros. El 2023 el ECA, en alianza con ANECAP, CI y DRIS, inició la implementación de Wanamei, el primer proyecto de RIA con enfoque de contrato de administración en la cuenca amazónica.
En lo que respecta a la ANP, la RCAMA es la segunda reserva comunal de mayor extensión después de la RCESR. Se estableció el 9 de mayo de 2002 y tiene una extensión de 402.335,62 has. Está ubicada en la Amazonía sur, en la región de Madre de Dios. En 2018 la RCAMA fue incorporada a la Lista Verde de la UICN.